The dataset on testate amoebae (Amphitremida; Arcellinida; Euglyphida) in Sphagnum bogs from Eastern Fennoscandia (Northern Karelia)

Occurrence
Dernière version Publié par Penza State University le mai 20, 2024 Penza State University
Date de publication:
20 mai 2024
Publié par:
Penza State University
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

The dataset consists of 3064 occurrence entries of testate amoebae taxa, obtained from 236 surface moss samples, collected in 11 Sphagnum bogs from Eastern Fennoscandia (Northern Karelia; Karelia Republic and Murmansk district, Russia). Sample collecting was carried out by Yuri Mazei, either directly or under his supervising, in 2004–2022 years. Each sample series is designated as a single “parent event” and represents a set of samples (“sample events”), collected at one day at a single bog. In the case a bog was sampled several times, navigation across the dataset can be done using bog designations (“location IDs”) and sample dates (“event dates”). For each bog, a unique couple of geographical coordinates is reported, therefore the geographical coordinates represent bog locations across the dataset. Most sample series were described in publications (Mazei et al., 2009a, 2009b, 2010, 2011; Mazei and Bubnova, 2009; Mazei and Kabanov, 2008; Malysheva and Mazei, 2013).

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 3 064 enregistrements.

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Versions

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Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Ivanovskii A A, Babeshko K V, Chernyshov V A, Esaulov A S, Komarov A A, Mazei N G, Meskhadze D L, Saldaev D A, Tsyganov A N, Bubnova O A, Kabanov A N, Mazei Y A (2024). The dataset on testate amoebae (Amphitremida; Arcellinida; Euglyphida) in Sphagnum bogs from Eastern Fennoscandia (Northern Karelia). Version 1.6. Penza State University. Occurrence dataset. http://gbif.ru:8080/ipt/resource?r=karelia2023&v=1.6

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Penza State University. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 5e3e9a4c-beae-425c-9b91-f89807a12704.  Penza State University publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Participant Node Managers Committee.

Mots-clé

Occurrence

Contacts

Aleksandr A Ivanovskii
  • Créateur
  • Associate professor
Lomonosov Moscow State University
RU
Kirill V Babeshko
  • Créateur
  • Associate professor
Lomonosov Moscow State University
RU
Viktor A Chernyshov
  • Créateur
  • Associate professor
Penza State University
RU
Anton S Esaulov
  • Créateur
  • Personne De Contact
  • Associate professor
Shenzhen MSU-BIT University
  • No. 1, International University Park Road
518172 Shenzhen
CN
  • 15994709513
A. A. Komarov
  • Créateur
  • Associate professor
Penza State University
RU
N. G. Mazei
  • Créateur
  • Senior Researcher
Lomonosov Moscow State University
D. L. Meskhadze
  • Créateur
  • Bachelor student
Shenzhen MSU-BIT University
CN
Damir A Saldaev
  • Créateur
  • Professor
Lomonosov Moscow State University
RU
A. N. Tsyganov
  • Créateur
  • Leading Researcher
Lomonosov Moscow State University
Moscow
RU
O. A. Bubnova
  • Créateur
  • Associate professor
Penza State University
RU
A. N. Kabanov
  • Créateur
  • Staff member
Penza State University
RU
Y. A. Mazei
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
  • Professor
Lomonosov Moscow State University
RU
Anton Esaulov

Couverture géographique

Eastern Fennoscandia, 11 bogs in the vicinity of Kandalaksha Bay shore, White Sea.

Enveloppe géographique Sud Ouest [66,522, 32,55], Nord Est [67,529, 33,455]

Couverture taxonomique

N/A

Kingdom Protozoa, Chromista
Class Imbricatea, Tubulinea, Labyrinthulomycetes
Family Netzeliidae, Assulinidae, Euglyphidae, Arcellidae, Centropyxidae, Trinematidae, Difflugiidae, Hyalospheniidae, Cyphoderiidae, Amphitremidae, Incertae sedis

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2004-06-01 / 2004-08-31
Date de début 2007-07-30
Date de début / Date de fin 2009-06-01 / 2009-08-31
Date de début / Date de fin 2017-06-21 / 2017-06-25
Date de début 2022-06-12

Méthodes d'échantillonnage

At each bog, sample points of a sample series encompassed a complete microtopographical gradient (moss hummocks, even moss plots, pools) or represented a gradient “open bog – forest”.

Etendue de l'étude 11 Sphagnum bogs from Eastern Fennoscandia (Northern Karelia; Karelia Republic and Murmansk district, Russia). Totally 236 samples of surface moss substrate from 17 sample series (referred as “parent event IDs” in the dataset). Each sample series is a set of samples (“sample events”), collected at one day at a single bog.

Description des étapes de la méthode:

  1. Sample collection and laboratory sample preparation were carried out by standard methods (Hendon and Charman, 1997; Mazei et al., 2011; Tsyganov et al., 2012). To make data consistent across the dataset, taxa abundancies are reported as percentage relative abundancies of shell numbers.

Citations bibliographiques

  1. González-Miguéns R., Todorov M., Blandenier Q., Duckert C., Porfirio-Sousa A.L., Ribeiro G.M., Ramos D., Lahr D.J.G., Buckley D., Lara E. Deconstructing Difflugia: The tangled evolution of lobose testate amoebae shells (Amoebozoa: Arcellinida) illustrates the importance of convergent evolution in protist phylogeny // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2022. Vol. 175. P. 107557. DOI: 10.1016/j.ympev.2022.107557
  2. Hendon D., Charman D.J. The preparation of testate amoebae (Protozoa: Rhizopoda) samples from peat // The Holocene. 1997. Vol. 7, № 2. P. 199–205. DOI: 10.1177/095968369700700207
  3. Kosakyan A., Gomaa F., Lara E., Lahr D.J.G. Current and future perspectives on the systematics, taxonomy and nomenclature of testate amoebae // European Journal of Protistology. 2016. Vol. 55. P. 105–117. DOI: 10.1016/j.ejop.2016.02.001
  4. Malysheva Ye.A., Mazei Yu.A. Struktura soobshchestva rakovinnykh ameb v kontaktnoy zone “les – sfagnovoye boloto” na severe Karelii // XXI vek: itogi proshlogo i problemy nastoyashchego Plyus. 2013. V. 2, iss. 9 (13). P. 35–41. (in Russian) [Малышева Е.А., Мазей Ю.А. Структура сообщества раковинных амеб в контактной зоне “лес – сфагновое болото” на севере Карелии // XXI век: итоги прошлого и проблемы настоящего Плюс. 2013. Т. 2, № 9 (13). C. 35–41.]
  5. Mazei Yu.A., Blinokhvatova Yu.V., Embulaeva E.A. Specific features of the microspatial distribution of soil testate amoebae in the forests of the Middle Volga region // Arid Ecosystems. 2011. Vol. 1, iss. 1. P. 46–52. DOI: 10.1134/S2079096111010069
  6. Mazei Yu.A., Bubnova O.A. Vidovoy sostav i struktura soobshchestva rakovinnykh ameb v severotayezhnom sosnovo-sfagnovom bolote (Kareliya, Rossiya) // Byulletenʹ Moskovskogo obshchestva ispytateley prirody. Otdel biologicheskiy. 2009. V. 114, iss. 6. P. 15–23. (in Russian) [Мазей Ю.А., Бубнова О.А. Видовой состав и структура сообщества раковинных амеб в северотаежном сосново-сфагновом болоте (Карелия, Россия) // Бюллетень Московского общества испытателей природы. Отдел биологический. 2009. Т. 114, № 6. С. 15–23.]
  7. Mazei Yu.A., Bubnova O.A., Chernyshov V.A. Struktura soobshchestva rakovinnykh amëb v sfagnovoy splavine severotayezhnogo bolota (Kareliya, Rossiya) // Povolzhskiy ekologicheskiy zhurnal. 2009. Iss. 2. P. 115–124. (in Russian) [Мазей Ю.А., Бубнова О.А., Чернышов В.А. Структура сообщества раковинных амёб в сфагновой сплавине северотаежного болота (Карелия, Россия) // Поволжский экологический журнал. 2009. № 2. С. 115–124.]
  8. Mazei Yu.A., Bubnova O.A., Tsyganov A.N., Chernyshov V.A. Struktura soobshchestva rakovinnykh ameb v gryadovo-ozerkovom bolotnom komplekse severnoy taygi (Kareliya, Rossiya) // Izvestiya Samarskogo nauchnogo tsentra Rossiyskoy akademii nauk. 2010. V. 12, iss 1. P. 99–102. (in Russian) [Мазей Ю.А., Бубнова О.А., Цыганов А.Н., Чернышов В.А. Структура сообщества раковинных амеб в грядово-озерковом болотном комплексе северной тайги (Карелия, Россия) // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2010. Т. 12, № 1. С. 99–102.]
  9. Mazei Yu.A., Kabanov A.N. Rakovinnyye ameby v osokovo-sfagnovom zabolochennom lesu na severe Karelii // Izvestiya Penzenskogo gosudarstvennogo pedagogicheskogo universiteta im. V.G. Belinskogo. Ser. Yestestvennyye nauki. 2008. № 10(14). P. 101–104. (in Russian) [Мазей Ю.А., Кабанов А.Н. Раковинные амебы в осоково-сфагновом заболоченном лесу на севере Карелии // Известия Пензенского государственного педагогического университета им. В.Г. Белинского. Сер. Естественные науки. 2008. № 10(14). С. 101–104.]
  10. Mazei Yu.A., Tsyganov A.N., Bubnova O.A. Vidovoy sostav i struktura soobshchestv rakovinnykh ameb v sfagnovom bolote na severe Karelii (Pribelomorskaya nizmennostʹ) // Zoologicheskiy zhurnal. 2009. V. 88, iss. 7. P. 771–782. (in Russian) [Мазей Ю.А., Цыганов А.Н., Бубнова О.А. Видовой состав и структура сообществ раковинных амеб в сфагновом болоте на севере Карелии (Прибеломорская низменность) // Зоологический журнал. 2009. Т. 88, № 7. С. 771–782.]
  11. Mazei, Yu.A.; Tsyganov, A.N. Freshwater Testate Amoebae. Moscow: KMK, 2006. 300 p. ISBN 5-87317-336-2
  12. Ruggiero M.A., Gordon D.P., Orrell T.M., Bailly N., Bourgoin T., Brusca R.C., Cavalier-Smith T., Guiry M.D., Kirk P.M. A Higher Level Classification of All Living Organisms // PLOS ONE. Public Library of Science, 2015. Vol. 10, № 4. P. e0119248. DOI: 10.1371/journal.pone.0119248
  13. Tsyganov A.N., Babeshko K.V., Mazei Yu.A. A Guide to Testate Amoebae with the Keys to Genera. Penza: Penza State University Publ., 2016. 132 p.
  14. Tsyganov A.N., Temmerman S., Ledeganck P., Beyens L. The Distribution of Soil Testate Amoebae under Winter Snow Cover at the Plot-scale Level in Arctic Tundra (Qeqertarsuaq/Disko Island, West Greenland) // Acta Protozoologica. 2012. Vol. 51, № 2. P. 155–167. DOI: 10.4467/16890027AP.12.012.0516

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 5e3e9a4c-beae-425c-9b91-f89807a12704
http://gbif.ru:8080/ipt/resource?r=karelia2023