Библиография

Обновлено 2021-03-11

Наталья Иванова, Максим Шашков, Нина Филиппова

Сборники материалов конференций

Специальный выпуск журнала ARPHA Proceedings III Russian National Conference “Information Technology in Biodiversity Research” на английском языке. DOI:  10.3897/ap.proceeding.e2961

Сборник материалов докладов международной конференции "Информационные технологии в исследовании биоразнообразия", посвященная  100-летию со дня рождения академика РАН Павла Леонидовича Горчаковского. Екатеринбург, 5–10 октября 2020 г. Статья о конференции в журнале "Фиторазнообразие Восточной Европы".

Российская конференция с международным участием "Передовые практики и перспективы использования зоологических коллекций" (к  90-летию Ольги Леонидовны Россолимо, директора Зоологического музея МГУ имени М.В. Ломоносова в 1970–2009 гг.) Москва, 15–16 октября 2018 г.

Тематический выпуск "Information Technologies in the Research of Biodiversity" в Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences.

Международная конференция (II) "Информационные технологии в исследовании биоразнообразия", Иркутск, 11–14 сентября 2018 г. 

Труды Кольского научного центра РАН. 2017. Вып. 5. I Международная научно-практическая конференция «Использование современных информационных технологий в ботанических исследованиях»

Международная научно-практическая конференция «Использование современных информационных технологий в ботанических исследованиях» Апатиты, Мурманская область 28-31 марта 2017 года 

 

Статьи о данных (data papers)

West of Urals 2020 - тематический выпуск журнала Biodiversity Data Journal (BDJ) со статьями о данных из Европейской части России

Ovaskainen, O., Meyke, E., Lo, C. et al. Chronicles of nature calendar, a long-term and large-scale multitaxon database on phenology. Sci Data 7, 47 (2020). https://doi.org/10.1038/s41597-020-0376-z

Malavin S, Shmakova L, Claverie J-M, Rivkina E (2020) Frozen Zoo: a collection of permafrost samples containing viable protists and their viruses. Biodiversity Data Journal 8: e51586. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e51586

Zheleznova G, Shubina T, Degteva S, Chadin I, Rubtsov M (2019) Moss occurrences in Yugyd Va National Park, Subpolar and Northern Urals, European North-East Russia. Biodiversity Data Journal 7: e32307. DOI: 10.3897/BDJ.7.e32307

Filippova N, Arefyev S, Zvyagina E, Kapitonov V, Makarova T, Mukhin V, Sedelnikova N, Stavishenko I, Shiryaev A, Tolpysheva T, Ryabitseva N, Paukov A (2020) Fungal literature records database of the Northern West Siberia (Russia). Biodiversity Data Journal 8: e52963. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e52963

Filippova N, Lapshina E (2019) Sampling event dataset on five-year observations of macrofungi fruit bodies in raised bogs, Western Siberia, Russia. Biodiversity Data Journal 7: e35674. DOI: 10.3897/BDJ.7.e35674

Chadin I, Dalke I, Zakhozhiy I, Malyshev R, Madi E, Kuzivanova O, Kirillov D, Elsakov V (2017) Occurrences of the invasive plant species Heracleum sosnowskyi Manden. in the Komi Republic territory (European North-East Russia). PhytoKeys 77: 71-80. https://doi.org/10.3897/phytokeys.77.11186

 

Моделирование ареалов

Лисовский А.А., Дудов С.В., Оболенская Е.В. Преимущества и ограничения методов экологического моделирования ареалов. 1. Общие подходы // Журнал общей биологии. 2020. 81(2): 123–134. DOI: 10.31857/S0044459620020037

Лисовский А.А., Дудов С.В. Преимущества и ограничения методов экологического моделирования ареалов. 2. MaxEnt // Журнал общей биологии. 2020. 81(2): 135–146. DOI: 10.31857/S0044459620020049 

Petrosyan, V.; Osipov, F.; Bobrov, V.; Dergunova, N.; Omelchenko, A.; Varshavskiy, A.; Danielyan, F.; Arakelyan, M. Species Distribution Models and Niche Partitioning among Unisexual Darevskia dahli and Its Parental Bisexual (D. portschinskiiD. mixta) Rock Lizards in the Caucasus. Mathematics 20208, 1329. https://doi.org/10.3390/math8081329

Kutueva AG, Fedorov NI, Muldashev AA, Galeeva AH, Naumova LG (2020) About potential area of Patrinia sibirica (L.) Juss. in the Southern Urals. ARPHA Proceedings 2: 1-7. DOI: 10.3897/ap.2.e57082

Афонин А.Н., Баранова О.Г., Федорова Ю.А. Характеристика северной границы распространения Аmbrosia artemisiifolia L. в Канаде в связи с определением экологических лимитов распространения вида на север // Вестн. Том. гос. ун-та. Биология. 2020. № 50. С. 28–51. DOI: 10.17223/19988591/50/2

Борисова Н.Г., Старков А.И., Лизунова А.В., Попов С.В., Ербаева М.А. Пространственная оценка климатической ниши даурской пищухи // Сибирский экологический журнал. 2020. № 5. С. 568-586. DOI: 10.15372/SEJ20200502

Санданов Д.В. Современные подходы к моделированию разнообразия и пространственному распределению видов растений: перспективы их применения в России | Вестн. Том. гос. ун-та. Биология. 2019. № 46. DOI: 10.17223/19988591/46/5

Кутуева А.Г., Мулдашев А.А., Галеева А.Х., Федоров Н.И. О потенциальном ареале и распространении вида-реликта плейстоценового комплекса Allium obliquum LEDEB // Естественные и технические науки. 2019. №10 (136). С. 149-154. DOI: 10.25633/ETN.2019.10.20

Корзников К.А., Кислов Д.Е., Крестов П.В. Моделирование биоклиматического ареала крупнотравных сообществ северо-восточной Азии // Экология. 2019. №3. С. 196-204. DOI: 10.1134/S0367059719030090

Болотов И.Н., Фролов А.А. Моделирование ареала и анализ вклада факторов в климатическую нишу Parnassius mnemosyne L. 1758 (Lepidoptera: Papilionidae) // Вестник Северного (Арктического) Федерального университета: серия "Естественные науки". 2015. №1. С. 56-67. eLIBRARY ID: 23141784

Цифровые коллекции

Ваганов А.В., Медведева К.В. СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ЦИФРОВОЙ КОЛЛЕКЦИИ "ВИРТУАЛЬНЫЙ ГЕРБАРИЙ ALTB" // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии. 2020. № 19-1. С. 260-263. DOI: 10.14258/pbssm.2020051

Жолнерова Е.А., Ваганов А.В., Шмаков А.И. Cемейство Liliaceae Juss. во флоре Алтайской горной страны. Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2020. – Т. 19, №2: 258-263

Seregin AP MOSCOW DIGITAL HERBARIUM: A CONSORTIUM SINCE 2019 // Taxon. 2020. 69(2). P. 417-419  DOI: 10.1002/tax.12228

Серегин А.П., Каширина Е.С. Новые массивы электронных данных о флористическом разнообразии Северо-Западного Кавказа // Бюллетень МОИП. Отдел биологический. 2020. Т. 125. №2. С. 60-62.

Kovtonyuk N., HanI., GatilovaE., Friesen N. (2020) Genus Allium in CSBG Digital Herbarium // International Conferences “Plant Diversity: Status, Trends, Conservation Concept”/ BIO Web of Conferences 24, 00042. https://doi.org/10.1051/bioconf/20202400042

Shukherdorj Baasanmunkh, Nataliya K. Kovtonyuk, Batlai Oyuntsetseg, Zagarjav Tsegmed, Irina V. Han and Hyeok Jae Choi (2020). Diversity and distribution of the genus Primula L. (Primulaceae) in Mongolia // Journal of Asia – Pacific Biodiversity. https://doi.org/10.1016/j.japb.2020.09.002

Gatilova E., Han I., Kovtonyuk N.(2020) Digital inventory of the Foreign Asia section in I.M. Krasnoborov herbarium collection // Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation. 9 (2).  DOI: 10.17581/bp.2020.09213

Nataliya K. Kovtonyuk & Irina V. Belyaeva (2020). Lectotypification of the name Salix pseudodepressa (Salicaceae) // Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation. 2020. 9(1): 175–177. DOI: 10.17581/bp.2020.09108

Ковтонюк Н.К., Хан И.В., Гатилова Е.А., Пшеничкина Ю.А. ЦИФРОВОЙ ГЕРБАРИЙ ЦСБС СО РАН  В ГЛОБАЛЬНОЙ ИНФОРМАЦИОННОЙ СИСТЕМЕ ПО БИОРАЗНООБРАЗИЮ // Растительный мир Азиатской России, 2019, № 4(36), С. 68-73 DOI: 10.21782/RMAR1995-2449-2019-4(68-73)

Kovtonyuk N., Andro-Durand V. (2019). Typification of Primula L. (Primulaceae), described by A. Franchet in 1886 from China and eastern Tibet // Adansonia. V. 41. No.1. P. 75–89. DOI: 10.5252/adansonia2019v41a9

Kovtonyuk N.K., Tomoshevich M.A., Banaev E.V. (2019). Typification of the name Nitraria komarovii (Nitrariaceae) // Botanica Pacifica. V. 8. No 2. P. 115-118. DOI: 10.17581/bp.2019.08210

Kovtonyuk, N.K., Han, I.V., Gatilova, E.A., 2018. Digitization of vascular plant herbarium collections at the Central Siberia Botanical Garden, Novosibirsk, Russia. Skvortsovia 4 (3), 100–111.

Kovtonyuk N., Han I., Gatilova E. (2019). Digital Herbarium Collections of the Central Siberian Botanical Garden SB RAS, Novosibirsk, Russia. In: Bychkov I., Voronin V. (eds) Information Technologies in the Research of Biodiversity. Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. Springer, Cham. – pp. 22–27. https://doi.org/10.1007/978-3-030-11720-7_4

Калякин М.В., Серегин А.П., Соловченко А.Е., Каменский П.А., Садовничий В.А. ПРОЕКТ "НОЕВ КОВЧЕГ": ПРОМЕЖУТОЧНЫЕ ИТОГИ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ КЛАССИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ // ACTA NATURAE. 2018. Т. 10. №4(39). С. 49-58.

Seregin A. P. The largest digital herbarium in Russia is now available online! // Taxon. 2018. V. 67 (2). P. 465–467. DOI: 10.12705/672.34

Ковтонюк Н.К., Хан И.В., Гатилова Е.А. Семейство Primulaceae в виртуальном гербарии Центрального сибирского ботанического сада СО РАН // Растительный мир Азиатской России. 2018. №4. С. 19-29. DOI: 10.21782/RMAR1995-2449-2018-4(19-29)

Kovtonyuk N., Han I. and Gatilova E. (2018). Digitization of vascular plant herbarium collections at the Central Siberian Botanical Garden, Novosibirsk, Russia // Skvortsovia,  4 (3): 100-111 http://doi.org/10.5281/zenodo.4103391

Kovtonyuk N.K. (2018) Kovtonyuk Nataliya. (2018). Lectotypification of name Ranunculus taigaensis (Ranunculaсeae). Новости систематики высших растений / Novitates systematicae plantarum vascularium, 48, 65–67. http://doi.org/10.5281/zenodo.4164901

Серегин А.П. ГЕРБАРИЙ МОСКОВСКОГО УНИВЕРСИТЕТА (MW) СЕГОДНЯ: ФОНДЫ, ОНЛАЙН ДОСТУП И НАУЧНАЯ РАБОТА // Ботанический журнал. 2017. Т. 102. №3. С. 281-308. DOI: 10.1134/S0006813617030012

Ковтонюк Н.К. Виртуальные гербарные коллекции как ресурс для изучения таксономии и биоразнообразия // Растительный мир Азиатской России. 2017. №1. С. 98-104. DOI: 10.21782/RMAR1995-2449-2017-1(98-104)

 

Описание ресурсов

Filippova N, Filippov I, Ivanova N (2019) Biodiversity Portal of the Northern Part of West Siberia, Russia. Biodiversity Information Science and Standards 3: e37067. https://doi.org/10.3897/biss.3.37067

Vaganov, A., Shmakov, A., & Gudkova, P. (2019). Global data on biodiversity of the Altai mountain country, presented in the world’s scientific depositories. Acta Biologica Sibirica5(2), 95-101. https://doi.org/10.14258/abs.v5.i2.5937

Иванова Н.В., Шашков М.П., Шанин В.Н. Использование стандарта Darwin Core для обобщения данных о распространении охраняемых видов (на примере лишайника Lobaria pulmonaria) // Научные основы устойчивого управления лесами: Материалы II Всероссийской научной конференции (с международным участием). М.: ЦЭПЛ РАН, 2016. С. 98-99.

Ivanova N.V., Shashkov M.P. Biodiversity Databases in Russia: Towards a National Portal // Arctic Sciense. 2016. 3(3) DOI: 10.1139/AS-2016-0050

Ivanova N.V., Shashkov M.P. Application of Darwin Core standard to summarize the data of occurrences of the protected species (the example of the lichen Lobaria pulmonaria) // Математическая биология и биоинформатика: VI Международная конф., г. Пущино, 16-21 октября 2016 г.: Доклады. М.: МАКС Пресс, 2016. С. 169-170.

 

Обзоры

Ivanova N, Shashkov M (2020) Contribution of Citizen Science to Biodiversity Data Mobilization in Russia. Biodiversity Information Science and Standards 4: e59197. https://doi.org/10.3897/biss.4.59197

Серегин А.П., Бочков Д.А., Шнер Ю.В. и др. “Флора России” на платформе iNaturalist: большие данные о биоразнообразии большой страны // Журнал общей биологии. 2020. Т. 81. №3. С. 223–233.  DOI: 10.31857/S0044459620030070

Ваганов А.В., Шмаков А.И., Гудкова П.Д. Глобальные данные о биоразнообразии Алтайской горной страны, представленные в мировых научных депозитариях // Acta Biologica Sibirica, 2019. 5(2), 95-101 https://doi.org/10.14258/abs.v5.i2.5937

Shashkov M, Ivanova N (2019) Considerable Progress in Russian GBIF Community. Biodiversity Information Science and Standards 3: e37015. https://doi.org/10.3897/biss.3.37015

Чадин И.Ф. Zenodo и GBIF: инструменты для публикации наборов первичных данных // Вестник Института биологии Коми НЦ УрО РАНю 2018. №3 (205). С. 34-36. DOI: https://doi.org/10.31140/j.vestnikib.2018.3(205).5

Филиппова Н.В., Филиппов И.В., Щигель Д.С., Иванова Н.В., Шашков М.П. Информатика биоразнообразия: мировые тенденции, состояние дел в России и развитие направления в Ханты-Мансийском Автономном Округе // Динамика окружающей среды и глобальные изменения климата. 2017. Т. 8. №. 2. С. 46–56. Полный текст

Vaganov A.V. Prospects for studying and preserving the biodiversity of the Altai-Sayan ecoregion in the context of the development of open databases // Ukrainian Journal of Ecology, 2018. – 8 (2). – 380–382.

Гребенников К.А. Изучение биоразнообразия заповедников России в цифровой эпохе: опыт и перспективы // Nature Conservation Research. Заповедная наука. 2016. №1 (2). С 1-10. Текст

 

Обучение

Endresen D, Abrahamyan A, Mirzorakhimov A, Melikyan A, Verstraete B, Schigel D, Makeyeva E, De Boer H, Russell L, Shashkov M, Mamadalieva M, Ivanova N, Voronova N, Borodin O, Prylutskyi O, Tykarski P, Johaadien R (2019) BioDATA: Biodiversity data mobilisation and data publication training in Eurasia. Biodiversity Information Science and Standards 3: e37543. https://doi.org/10.3897/biss.3.37543

 

Публикации, вышедшие до 2016 г., доступны в отдельном файле

В сотрудничестве с GBIF

gbiflogo

Biodiversity Information Standards

tdwglogo

iNaturalist

inatlogo

Atlas Of Living Australia

alalogo

Theme by Danetsoft and Danang Probo Sayekti inspired by Maksimer