Российская национальная конференция по информатике биоразнообразия

Немного истории

Программы для создания баз данных стали доступны биологам с появлением операционной системы Windows в 1990-х. В это время практически каждая группа, работающая в области изучения биоразнообразия, вела собственную базу данных. Первое совещание о биологических базах данных было организовано в 1990 г. в г. Пущино Московской области по инициативе Юрия Георгиевича Пузаченко (ИПЭЭ РАН) и его коллег (Смирнов и др., 2006). Затем совещания по этой тематики переместились в Санкт-Петербург, где проводились в Зоологическом институте РАН и Ботаническом институте РАН. В 1994 г. в Санкт-Петербурге состоялся первый международный симпозиум, посвященный базам данных в биологии, в последующие годы был проведен ряд конференций:

 

zin-conf-logo

Участники конференции "Информационно-поисковые системы в изучении биоразнообразия", ЗИН РАН, 1999 г. (источник)

 

В 2005 г. в Зоологическом институте РАН состоялась ежегодная конференция рабочей группы TDWG.

  • 5-й международный симпозиум «Электронные биологические коллекции: теории, стандарты и перспективы использования» («Taxonomic Databases Working Group 2005 Annual Meeting») (Berendsohn, Rissone, 2005)

В 2006 г. состоялась 6-я конференция «Информационные системы и WEB-порталы по разнообразию видов и экосистем» (Павлов и др., 2006), которая проходила в Институте биологии внутренних вод (пос. Борок, Ярославская обл.).

К сожалению, все эти активности не привели к созданию единых стандартов для представления данных. Большинство ресурсов, разработанных в этот период, в настоящее время не поддерживаются, или вовсе недоступны.

 

Информационные технологии в исследовании биоразнообразия

Традиция проведения тематических конференций возобновилась благодаря активности коллег из Кольского научного центра РАН. В 2017 г. состоялась

apatity2017

Участники конференции "Использование современных информационных технологий в ботанических исследованиях", Апатиты, 2017 г. Фото Организаторов конференции.

 

В работе конференции приняли участие 88 специалистов из России, Финляндии, Швеции и Дании. На конференции работали три секции:

1. Информационные системы (ИС) и базы данных.

2. Современные информационные технологии в обработке данных.

3. Применение дистанционных методов в картировании растительности и изучении биоразнообразия.

По итогам конференции был издан сборник тезисов докладов и специальный выпуск журнала "Труды Кольского научного центра РАН. Серия "Прикладная экология Севера". Конференция заложила хорошие традиции, и следующие совещания стали удобной площадкой для координации усилий по развитию и внедрению новейших методов обработки и хранения данных в России.

Огромная работа по организации конференции была проделана Организационным комитетом, который возглавили Денис Александрович Давыдов и Евгений Александрович Боровичев.

Через год конференция проводилась в Иркутске на базе Института динамики систем и теории управления СО РАН

irkut_photo

Участники конференции "Информационные технологии в исследовании биоразнообразия", Иркутск, 2018 г. (источник)

Конференция проходила на базе Института динамики систем и теории управления СО РАН, председатель Оргкомитета - Роман Константинович Федоров. Заместитель председателя - Алла Васильевна Верхозина (Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН).

На конференции состоялись заседания секций:

  • Глобальные порталы данных о биоразнообразии: интеграция данных, использование в задачах генерации знаний.
  • Информационно-аналитические системы по биоразнообразию. Электронные биологические коллекции.
  • Национальные данные о биоразнообразии: современное состояние оцифровки. Вопросы авторских прав, методы и концепции оценки качества данных.
  • Теоретические основы и технологии организации информационно-телекоммуникационных инфраструктур. Стандарты описания цифровых данных, сервисов обработки и т.д.
  • Методы, модели, программные системы и Веб-сервисы для анализа данных о биоразнообразии.
  • Применение дистанционных методов в картографировании растительности и изучении биоразнообразия.

В конференции приняли участие специалисты из России, Франции, Норвегии, Швеции, Дании, Китая, Польши и Республики Беларусь. Тезисы конференции опубликованы в сборнике на английском языке, расширенные материалы - в тематическом выпуске "Information Technologies in the Research of Biodiversity" издательства Springer 

Третья конференция состоялась в 2020 г. в Екатеринбурге, в Уральском федеральном университете Первого президента России Б.Н. Ельцина

bdi2020

Участники III конференции "Информационные технологии в исследовании биоразнообразия", Екатеринбург, 2020 г.
Фото Натальи Ивановой, CC-BY

Конференция включала следующие секции:

  • Глобальные порталы о биоразнообразии: интеграция данных и их использование в научных исследованиях
  • Мобилизация данных о биоразнообразии в России: опыт разработки баз данных и информационных систем
  • Современное состояние и перспективы оцифровки российских научных биологических коллекций
  • Биологическое разнообразие водных и наземных экосистем и методы его анализа
  • Применение ГИС-технологий и использование данных дистанционного зондирования в исследованиях биологического разнообразия.

Также на конференции состоялись 2 круглых стола:

  • Citizen science проекты для сбора научных данных о биоразнообразии
  • Совершенствование навыков работы с цифровыми данными о биоразнообразии в системе высшего образования

и 2 обучающих курса:

  • Подготовка данных для публикации в Глобальной информационной системе о биоразнообразии GBIF: практический семинар для начинающих.
  • Возможности использования Виртуальной лаборатории моделирования ареалов bccvl: семинар для продвинутых пользователей.

В работе конференции приняли участие более 120 исследователей из России, Дании, Норвегии, Болгарии, Германии, Республики Беларусь и Узбекистана. Материалы докладов на русском языке доступны в сборнике конференции.

Проведение конференции стало возможным благодаря трудам зам. председателя Программного комитета Алены Сергеевны Третьяковой, секретаря Оргкомитета Павла Вячеславовича Кондраткова и Виктории Дамировны Владыкиной.

 

IV Национальная научная конференция с международным участием «Информационные технологии в исследовании биоразнообразия» состоится в сентября 2022 г. в Новосибирске на базе Центрального сибирского ботанического сада СО РАН.

 

Список литературы

И.С. Смирнов, А.Л. Лобанов, О.Н. Пугачев, Д.В. Гельтман. 2006. К истории совещаний по биологическим (зоологическим и ботаническим) базам данных и информационно-поисковым системам в СССР и России // "Информационные системы и web-порталы по разнообразию видов и экосистем". Материалы международн. симпозиума. Борок, 28 ноября - 1 декабря 2006 г. Москва, Товарищество науч. изд. КМК, 2006. С. 18-20.

Степаньянц С.Д., Лобанов А.Л., Дианов М.Б. (под ред.) 1997. Базы данных и компьютерная графика в зоологических исследованиях. Труды Зоологического института РАН. Т. 269

Рысс А.Ю., Смирнов И.С. (под ред.) 1999. Информационно-поисковые системы в зоологии и ботанике. Труды Зоологического института РАН. Т. 287.

Рысс А.Ю., Минтер Д. (под ред.) 2001. Информационные и телекоммуникационные ресурсы в зоологии и ботанике. Тезисы 2-го международного симпозиума. СПб.

Алимов А.Ф. (под ред.) 2003. Информационные системы по биоразнообразию видов и экосистем: международный симпозиум, 1-4 Декабря 2003, Зоологический институт РАН, Санкт-Петербург, Россия: научная программа и тезисы докладов. СПб. 116 с.

Berendsohn W.F., Geoffroy M. Networking taxonomic concepts - uniting without 'Unitary-ism' // Biodiversity databases : techniques, politics, and applications. Boca Raton, London, New York: CRC Press, 2007. P. 13-22.

Павлов Д.С., Дгебуадзе Ю.Ю., Петросян В.Г. (под ред.) 2006. Информационные системы и WEB-Порталы по разнообразию видов и экосистем. Материалы международного симпозиума. М.: Т-во научных изданий КМК. 261 с.

В сотрудничестве с GBIF

gbiflogo

Biodiversity Information Standards

tdwglogo

iNaturalist

inatlogo

Atlas Of Living Australia

alalogo

Theme by Danetsoft and Danang Probo Sayekti inspired by Maksimer