Использование данных портала GBIF в научных исследованиях

Обновлено 2021-02-08, Наталья Иванова

 

С чего начать

Чтобы загрузить на свой компьютер данные, доступные через GBIF, необходимо создать учетную запись.

Инструкция Как создать учетную запись на портале GBIF.org

После этого вы можете формировать запросы, загружать данные и использовать их в соответствии с лицензией и соблюдением правил цитирования.

Инструкция Как загрузить данные, опубликованные в GBIF

 

Как цитировать данные, полученные через GBIF

Вы уже используете данные GBIF для повторного анализа? Не забывайте, что данные - это научный продукт, такой же как привычная научная статья, поэтому данные GBIF необходимо правильно использовать и цитировать. Загружая данные, доступные через портал GBIF, вы соглашаетесь с правилами их использования. На данные необходимо ссылаться в списке литературы, указывая DOI и даты обращения

При цитировании одного набора данных следует приводить в списке литературы информацию, указанную в разделе Citation на его веб-странице, – авторов первичных данных, название набора данных и номер версии, публикующую организацию, DOI, URL и дату обращения, например,

Karyakin I., Kamenskiy D., Grachev E., Shnayder E., Ebel A., Shtol D., Mashkov V. Birds of Northern Eurasia. Occurrence dataset. Sibecocenter LLC, 2018. DOI: 10.15468/hmqxgv (2020-01-27).

Формат автоматически сгенерированной ссылки может быть изменен в соответствии с правилами журнала, но указание DOI, даты обращения и GBIF как источника информации являются обязательными.

Обычно исследователи не используют исходные наборы данных GBIF целиком, а формируют поисковые запросы по определенным критериям. Результату каждого такого запроса всегда присваивается DOI, содержащий параметры поиска, ссылки на источники происхождения и авторство всех найденных записей, а также лицензию, по которой необходимо использовать данные. На рисунке ниже вы видите пример с результатами запроса данных о находках жужелиц (Carabidae) в России.

carabus

 

Результату запроса присвоен DOI:10.15468/dl.zjersc. Этот DOI необходимо указывать в списке литературы.

GBIF.org (16 September 2020) GBIF Occurrence Download https://doi.org/10.15468/dl.zjersc

Обратите внимание, что эти данные можно использовать только в некоммерческих целях (CC BY-NC 4.0). Если для ваших целях требуется менее строгая лицензия, это нужно указать при формировании поискового запроса.

 

Использование данных GBIF российскими исследователями

 

Почему важно правильно цитировать данные, полученные через GBIF

1. Данные - это такой же научный продукт, как и традиционные исследовательские статьи.

2. Правильно цитируя данные GBIF, вы обеспечиваете возможность проверяемости результатов вашего исследования рецензентами и коллегами. Обратите внимание, что данные в GBIF постоянно обновляются. Например, на 30 августа 2020 для территории России было доступно 8 139 записей о находках жужелиц (DOI: 10.15468/dl.b5wep8), а на 16 сентября 2020 - 13 894 (DOI:10.15468/dl.zjersc). Поэтому простое упоминание в тексте о том, что данные получены через GBIF равноценно утверждению, что в работе использована методика, опубликованная в журнале "Экология". По такой ссылке невозможно оценить, какие именно данные были использованы, а следовательно, доверять полученным результатам и выводам.

3. Цитирования отображаются на страницах наборов данных в GBIF (даже если в запросе была использована только одна запись), это позволяет отследить востребованность информации для разных таксонов и (или) территорий. 

 

Несколько примеров из уже опубликованных статей

Пример правильного цитирования данных, полученных через GBIF

Серегин А.П. Флора государственного заказника "Троеручица" (Тверская область) // Фиторазнообразие Восточной Европы. 2020. Т.XIV, № 1, с. 4–31 . DOI: 10.24411/2072-8816-2020-10061

Автором статьи сделан запрос, в котором из набора данных  "iNaturalist Research-grade Observations" выбраны только наблюдения сосудистых растений, относящиеся к территории заказника. Границы указаны в виде полигона в формате WKT. Результату этого запроса присвоен DOI: 10.15468/dl.vwtmj4, который был процитирован в списке литературы и в тексте статьи. Используя этот DOI вы легко можете найти данные, ставшие основой для исследования, загрузить их на свой компьютер и посмотреть параметры поискового запроса.

Примеры цитирований, которые можно улучшать

Казакова М.В., Соболев Н.А., Кугушева А.С. Ареал Iris aphylla (Iridaceae): материалы к изучению видов общеевропейского уровня охраны // Ботанический журнал. 2019. №1. Т. 104. С. 124-146. DOI: 10.1134/S0006813619010034

Авторами статьи проделана большая работа по составлению карты распространения изучаемого вида на основе анализа данных из разных источников, в т.ч. материалов зарубежных гербариев, доступных через GBIF. В списке литературы авторы приводят ссылки на наборы данных соответствующих коллекций, но ссылаются на коллекции в целом. Например, по ссылке на данные Британского музея Естественной истории, открывается набор данных, содержащий более 4 млн. записей. Чтобы посмотреть данные о находках целевого вида читателю необходимо проделать дополнительную работу. В данном случае для каждой анализируемой авторам следовало составить поисковый запрос для выбора сборов только Iris aphylla и цитировать данные по DOI запроса. 

 

В сотрудничестве с GBIF

gbiflogo

Biodiversity Information Standards

tdwglogo

iNaturalist

inatlogo

Atlas Of Living Australia

alalogo

Theme by Danetsoft and Danang Probo Sayekti inspired by Maksimer